在一次偶然的机会下，暖萌可爱的僵小鱼跟随鱼爹一起进入大学校园。对大学校园充满了好奇的小鱼趁鱼爹不注意偷偷溜走，却因此不幸和鱼爹走散……就在小鱼苦苦寻爹未果，以为自己又要变成一个无家可归的小可怜时，阴差阳错被大二女生田小去发现。暖心的小去不仅帮小鱼寻找鱼爹，还把无依无靠的小鱼带至203宿舍暂住。
在迷糊博士的指导下，猪猪侠与各种奇异的外星人接触相识，他和铁拳虎解决了孤独星人、量子星人、全城电子产品失灵等事件所带来的危机后，猪猪侠与伙伴们处理突发事件的能力得到了锻炼，逐渐成为一名合格的星际特工。迷糊博士本是超好玩联盟的创始人之一，为了躲避联盟首脑的通缉一直躲藏在童话星球，然而这一天，联盟的人终于找到迷糊老师藏身之处，由于双方实力差距悬殊，猪猪侠保护不了铁拳虎，连自己与伙伴都有生命危险，最后铁拳虎主动走向了联盟，以自己的心核换得大家的安全。
《呼噜小精灵第二季》继续讲述发生在来自睡不醒王国的呼噜小精灵和男孩可乐之间的故事。
