恐怖大王的威胁消除了，本院寺有恢复了平凡的日常生活。 在这座寺庙，住着一位大学生森里萤一，与三位女神。一年前，萤一打电话错打到女神事务所，并与女神贝璐丹蒂开始了同居生活，之后贝璐丹蒂的两位妹妹也住进了寺庙。 这一天，救助女神事务所的数据出现了问题，萤一的契约可能会被取消！而唯一恢复契约的方式就是萤一再次说出一年前的愿望，可是萤一却忘了当时所说的话。 到底当时萤一许下了什么愿望，他与贝璐丹蒂的幸福生活还能否继续？为了明天的幸福，今天一定要想起当时许下的心愿。 根据藤岛康介同名漫画改编的TV版动画第2季。
好不容易进入了大学，想要好好学习出人头地的“完美”男生李清吉，刚一入学就莫名被拐入了一个三流摇滚乐队，队长燕回空有一张帅脸却性格超差，这种颓废的生活根本是浪费青春！但是，他所弹奏的旋律，却唤起了李清吉尘封于心中的回忆……
仙乐国太子谢怜接连被贬后第三次飞升成仙，却不慎破坏了神官们的金殿，无人供奉的他只能下凡除鬼来换取功德作为补偿。在凡间的历练中，谢怜结识了两位来帮助他的小神官，并认识了诡王花城，四人一同解决了一件件诡谲的事件，并逐渐接触到了看似光鲜亮丽的仙界众神官的黯然往事。
1999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸；中东却因为连场大雨发生洪水；美国则遇到有史以来最寒冷的冬天。 11岁的少年八神太一（藤田淑子 配音），和伙伴石田大和（风间勇刀 配音）、武之内空（水谷优子 配音）、泉光子郎（天神有海 配音）、太刀川美美（前田爱 配音）、城户丈（菊池正美 配音）、高石武（小西寛子 配音）一起参加了夏令营，一次意外却被神秘地送到了一个多彩的数码世界。在那里，他们得到了叫做“数码宝贝”的搭档。进入数码世界后，八神太一一行人遇到了凶恶的怪兽贝壳兽，眼看大家都要被抓住的时候，太一的亚古兽忽然进化成为暴龙兽，拯救了他们。进化到底是怎么回事情？数码世界究竟是什么？无数的谜团出现在被召选的小朋友们面前，精彩的冒险就这样开始了……
